Em 1965, um grupo de educadores, liderados pelos professores Gilberto Padovese (1937–2011) e Hermes Ferreira Figueiredo (1938–2021), iniciou um projeto educacional com a oferta de um curso preparatório voltado ao ingresso no curso ginasial da rede pública, então altamente concorrido. Os recursos obtidos com essa iniciativa possibilitaram a construção das quatro primeiras salas de aula, marco físico e simbólico do início de uma trajetória de compromisso com a educação.
Com a estrutura concluída, em 1966 foram iniciadas as atividades do Colégio Cruzeiro do Sul, inicialmente com a oferta do curso ginasial para crianças e adolescentes. Com o passar dos anos, a instituição expandiu sua atuação, incorporando os cursos do ensino primário e do colegial, consolidando-se como uma referência educacional na região e lançando as bases para o que se tornaria, décadas depois, um dos maiores grupos educacionais do País.